ट्रान्समेम्ब्रेन पेप्टाइड्सको संरचनात्मक विशेषताहरू र वर्गीकरण

Cationic transmembrane peptides arginine, lysine, and histidine मा समृद्ध छोटो पेप्टाइडहरू जस्तै TAT, Penetratin, Polyarginine, P22N, DPV3 र DPV6 मिलेर बनेको हुन्छ।तिनीहरूमध्ये, अर्जिनिनमा गुआनिडाइन हुन्छ, जसले कोष झिल्लीमा नकारात्मक रूपमा चार्ज गरिएको फस्फोरिक एसिड समूहहरूसँग हाइड्रोजन बन्ड गर्न सक्छ र शारीरिक PH मानको अवस्थामा झिल्लीमा ट्रान्समेम्ब्रेन पेप्टाइडहरू मध्यस्थता गर्न सक्छ।oligarginine को अध्ययन (3 R देखि 12 R सम्म) ले देखाएको छ कि झिल्ली प्रवेश क्षमता तब मात्र प्राप्त हुन्छ जब आर्जिनिन को मात्रा 8 को रूपमा कम थियो, र झिल्ली प्रवेश क्षमता बिस्तारै arginine को मात्रा को वृद्धि संग बढ्यो।लाइसिन, आर्जिनिन जस्तै क्याशनिक भए तापनि, यसमा गुआनिडाइन हुँदैन, त्यसैले जब यो एक्लै हुन्छ, यसको झिल्ली प्रवेश दक्षता धेरै उच्च हुँदैन।Futaki et al।(2001) राम्रो झिल्ली प्रवेश प्रभाव तब मात्र प्राप्त गर्न सकिन्छ जब cationic सेल झिल्ली प्रवेश पेप्टाइड कम्तिमा 8 सकारात्मक चार्ज एमिनो एसिड समावेश गर्दछ।यद्यपि सकारात्मक रूपमा चार्ज गरिएको एमिनो एसिड अवशेषहरू झिल्लीमा प्रवेश गर्न पेप्टाइड पेप्टाइडहरूको लागि आवश्यक छ, अन्य एमिनो एसिडहरू समान रूपमा महत्त्वपूर्ण छन्, जस्तै जब W14 F मा उत्परिवर्तन हुन्छ, पेनेट्रेटिनको प्रवेश क्षमता हराउँछ।

cationic transmembrane peptides को एक विशेष वर्ग परमाणु स्थानीयकरण अनुक्रम (NLSs) हो, जसमा आर्जिनिन, लाइसिन र प्रोलाइनमा धनी छोटो पेप्टाइडहरू हुन्छन् र आणविक छिद्र कम्प्लेक्स मार्फत न्यूक्लियसमा सार्न सकिन्छ।NLSs लाई क्रमशः आधारभूत एमिनो एसिडको एक र दुई क्लस्टरहरू मिलेर एकल र डबल टाइपिङमा विभाजन गर्न सकिन्छ।उदाहरण को लागी, simian भाइरस 40(SV40) बाट PKKKRKV एकल टाइप NLS हो, जबकि परमाणु प्रोटीन एक डबल टाइप NLS हो।KRPAATKKAGQAKKKL छोटो अनुक्रम हो जसले झिल्ली ट्रान्समेम्ब्रेनमा भूमिका खेल्न सक्छ।धेरै जसो NLS को चार्ज नम्बर 8 भन्दा कम छ, NLSs प्रभावकारी ट्रान्समेम्ब्रेन पेप्टाइडहरू होइनन्, तर तिनीहरू प्रभावकारी ट्रान्समेम्ब्रेन पेप्टाइड हुन सक्छन् जब सहसंयोजक रूपमा हाइड्रोफोबिक पेप्टाइड अनुक्रमहरूमा एम्फिफिलिक ट्रान्समेम्ब्रेन पेप्टाइडहरू गठन गर्न जोडिन्छ।