डिजाइन योजना र polypeptide पेप्टाइड श्रृंखला को समाधान

I. सारांश
पेप्टाइडहरू विशेष म्याक्रोमोलिक्युलहरू हुन् जुन तिनीहरूको अनुक्रमहरू तिनीहरूको रासायनिक र भौतिक विशेषताहरूमा असामान्य हुन्छन्।केही पेप्टाइडहरू संश्लेषण गर्न गाह्रो हुन्छन्, जबकि अरूहरू संश्लेषण गर्न अपेक्षाकृत सजिलो हुन्छन् तर शुद्ध गर्न गाह्रो हुन्छन्।व्यावहारिक समस्या यो हो कि धेरैजसो पेप्टाइडहरू जलीय घोलहरूमा थोरै घुलनशील हुन्छन्, त्यसैले हाम्रो शुद्धीकरणमा, हाइड्रोफोबिक पेप्टाइडको सम्बन्धित भाग गैर-जलीय विलायकहरूमा घुलनशील हुनुपर्छ, त्यसैले, यी विलायकहरू वा बफरहरू प्रयोगमा गम्भीर रूपमा असंगत हुने सम्भावना हुन्छ। जैविक प्रयोगात्मक प्रक्रियाहरूको, ताकि प्राविधिकहरूलाई तिनीहरूको आफ्नै उद्देश्यका लागि पेप्टाइड प्रयोग गर्नबाट कडा रूपमा निषेध गरिएको छ, ताकि शोधकर्ताहरूको लागि पेप्टाइडहरूको डिजाइनका धेरै पक्षहरू निम्न छन्।

डिजाइन योजना र polypeptide पेप्टाइड श्रृंखला को समाधान
दोस्रो, सिंथेटिक कठिन पेप्टाइड्स को सही छनोट
1. डाउन-रेगुलेट गरिएको अनुक्रमहरूको कुल लम्बाइ
15 भन्दा कम अवशेषहरूको पेप्टाइडहरू प्राप्त गर्न सजिलो हुन्छ किनभने पेप्टाइडको आकार बढ्छ र कच्चा उत्पादनको शुद्धता घट्छ।पेप्टाइड चेनको कुल लम्बाइ २० अवशेषहरू भन्दा बढि हुँदा, सटीक उत्पादन मात्रा एक प्रमुख चिन्ताको विषय हो।धेरै प्रयोगहरूमा, 20 भन्दा कम अवशेष संख्या घटाएर अप्रत्याशित प्रभावहरू प्राप्त गर्न सजिलो छ।
2. हाइड्रोफोबिक अवशेषहरूको संख्या घटाउनुहोस्
हाइड्रोफोबिक अवशेषहरूको ठूलो प्रबलता भएका पेप्टाइडहरू, विशेष गरी सी-टर्मिनसबाट 7-12 अवशेषहरूमा, सामान्यतया सिंथेटिक कठिनाइहरू निम्त्याउँछ।यसलाई एक अपर्याप्त संयोजनको रूपमा हेरिन्छ किनभने संश्लेषणमा बी-फोल्ड पाना प्राप्त हुन्छ।"यस्ता अवस्थामा, यो दुई भन्दा बढी सकारात्मक र नकारात्मक अवशेषहरू रूपान्तरण गर्न, वा पेप्टाइड संरचना अनलक गर्न पेप्टाइडमा ग्लाइ वा प्रो राख्न उपयोगी हुन सक्छ।"
3. "कठिन" अवशेषहरूको डाउनरेगुलेसन
"त्यहाँ धेरै Cys, Met, Arg, र प्रयास अवशेषहरू छन् जुन सामान्यतया सजिलै संग संश्लेषित हुँदैनन्।"Ser लाई सामान्यतया Cys को nonoxidative विकल्पको रूपमा प्रयोग गरिनेछ।
डिजाइन योजना र polypeptide पेप्टाइड श्रृंखला को समाधान

तेस्रो, पानीमा घुलनशील को सही छनोट सुधार गर्नुहोस्
1. N वा C टर्मिनस समायोजन गर्नुहोस्
अम्लीय पेप्टाइड्ससँग सापेक्ष (अर्थात, pH 7 मा नकारात्मक रूपमा चार्ज गरिएको), एसिटिलेशन (N-टर्मिनस एसिटिलेशन, सी टर्मिनसले सधैं निःशुल्क कार्बोक्सिल समूह कायम राख्छ) विशेष गरी नकारात्मक चार्ज बढाउन सिफारिस गरिन्छ।यद्यपि, आधारभूत पेप्टाइड्सका लागि (जसले pH 7 मा सकारात्मक रूपमा चार्ज गरिएको छ), एमिनेसन (N-टर्मिनसमा नि: शुल्क एमिनो समूह र C-टर्मिनसमा एमिनेसन) विशेष गरी सकारात्मक चार्ज बढाउन सिफारिस गरिन्छ।

2. क्रमलाई ठूलो रूपमा छोटो वा लम्बाउनुहोस्

केही क्रमहरूमा धेरै मात्रामा हाइड्रोफोबिक एमिनो एसिडहरू हुन्छन्, जस्तै Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr र Ala, आदि। जब यी हाइड्रोफोबिक अवशेषहरू 50% भन्दा बढी हुन्छन्, तिनीहरू सामान्यतया भंग गर्न सजिलो हुँदैनन्।पेप्टाइडको सकारात्मक र नकारात्मक ध्रुवहरूलाई थप बढाउनको लागि अनुक्रम लामो गर्न यो उपयोगी हुन सक्छ।दोस्रो विकल्प हाइड्रोफोबिक अवशेषहरू डाउनरेगुलेट गरेर सकारात्मक र नकारात्मक ध्रुवहरू बढाउन पेप्टाइड चेनको आकारलाई घटाउनु हो।पेप्टाइड श्रृंखलाको सकारात्मक र नकारात्मक पक्षहरू जति बलियो हुन्छन्, पानीसँग प्रतिक्रिया गर्ने सम्भावना बढी हुन्छ।
3. पानीमा घुलनशील अवशेषमा राख्नुहोस्
केही पेप्टाइड चेनहरूको लागि, केही सकारात्मक र नकारात्मक एमिनो एसिडहरूको संयोजनले पानीको घुलनशीलता सुधार गर्न सक्छ।हाम्रो कम्पनीले एसिडिक पेप्टाइडहरूको एन-टर्मिनस वा सी-टर्मिनसलाई ग्लु-ग्लुसँग जोड्न सिफारिस गर्छ।आधारभूत पेप्टाइडको N वा C टर्मिनस दिइएको थियो र त्यसपछि Lys-Lys।यदि चार्ज गरिएको समूह राख्न सकिँदैन भने, Ser-Gly-Ser लाई N वा C टर्मिनसमा पनि राख्न सकिन्छ।यद्यपि, यो दृष्टिकोणले काम गर्दैन जब पेप्टाइड चेनको पक्षहरू परिवर्तन गर्न सकिँदैन।